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Episcanner parameters

Dados do EpiScanner

Aqui você tem acesso a dados em tempo real do Epi-Scanner. A ferramenta Epi-Scanner foi co-desenvolvida pelo projeto InfoDengue. O conjunto de dados fornece estimativas de parâmetros epidemiológicos para cada cidade e ano no Brasil, com foco em Dengue e Chikungunya. Informações detalhadas sobre a metodologia usada para calcular esses parâmetros podem ser encontradas aqui.

Tabela de Parâmetros

Entrada

Nome do Parâmetro Obrigatório Tipo Descrição
disease sim str Doença específica. Opções: dengue, zika, chik
uf sim str (UF) Abreviação de duas letras do estado brasileiro. Ex: SP
year não int Ano específico. Padrão: ano atual

Saída

Nome do Parâmetro Tipo Descrição
disease str dengue, zika ou chik
CID10 str Código CID da doença
year int Ano analisado
geocode int Código geográfico da cidade
muni_name str Nome da cidade
peak_week float Semana epidemiológica estimada do pico da epidemia
beta float Taxa de transmissibilidade
gamma float Taxa de recuperação
R0 float Número reprodutivo básico
total_cases int Número total anual de casos
alpha float Parâmetro do modelo de Richard
sum_res float Soma dos resíduos (ver documentação)
ep_ini str Semana de início estimada da epidemia. Formato: AAAAAS
ep_end str Semana de término estimada da epidemia. Formato: AAAAAS
ep_dur int Duração estimada da epidemia em semanas

Exemplos de uso

import mosqlient

mosqlient.get_episcanner(
    api_key = api_key,
    disease = "dengue",
    uf = "SP"
)

library(httr)
library(jsonlite)

episcanner_api <- "https://api.mosqlimate.org/api/datastore/episcanner/"

params <- list(
    disease = "dengue",
    uf = "SP"
)

headers <- add_headers(
  `X-UID-Key` = API_KEY
)

resp <- GET(episcanner_api, query = params, headers)

items <- fromJSON(rawToChar(resp$content))

curl -X 'GET' \
'https://api.mosqlimate.org/api/datastore/episcanner/?disease=dengue&uf=SP' \
-H 'accept: application/json' \
-H 'X-UID-Key: See X-UID-Key documentation' \
-d ''